畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2022年第11期:基于网络药理学探讨黄芩素对猪丁型冠状病毒感染的潜在作用机制

发布日期:

作者:刘贺娟, 史晨曦, 王静, 王美乐, 王栋涵, 魏战勇, 尹素改

单位:1. 河南中医药大学医学院, 郑州 450046;2. 河南农业大学动物医学院, 郑州 450046

关键词:网络药理学,黄芩素,猪丁型冠状病毒,抗病毒作用机制

基金:河南省杰出青年基金(202300410192);国家自然科学基金(31972678);河南省科技公关项目(202102310504)

本研究旨在探讨黄芩素抗猪丁型冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)感染的作用机制。通过Pharmmapper、Pubchem、STITCH、TCMSP和Swiss Targer Prediction数据库获得黄芩素的作用靶点。根据前期蛋白组学结果获得PDCoV感染的相关靶点,获取黄芩素与PDCoV感染的共同靶点,并利用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-疾病-靶点”网络和靶蛋白相互作用网络,利用CytoNCA插件进行网络拓扑分析和核心网络构建,使用Metascape数据库对核心网络基因进行GO和KEGG分析。通过细胞试验对富集得到的信号通路下游基因表达水平进行检测。通过筛选,共获得黄芩素的潜在靶基因268个,黄芩素-PDCoV的共同靶点75个,GO富集结果表明黄芩素主要参与细胞周期、细胞膜筏形成、线粒体膜形成、纺锤体形成和MAPK信号级联传导过程;KEGG富集筛选得到277条信号通路(P<0.01),主要涉及PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路和MAPK信号通路等。细胞试验结果表明,与正常细胞对照组相对,病毒感染后PI3K、AKT、NF-κB mRNA表达显著升高;与病毒感染组相比,黄芩素处理组PI3K、AKT、NF-κB mRNA的表达显著降低(P<0.05)。黄芩素对PDCoV感染的作用具有多靶点、多通路的特点,可能是通过作用于AKT1、HSP90AA1、SRC、EGFR、CASP3、MAPK、STAT3等核心基因调控PI3K-Akt、Ras和MAPK信号通路、细胞凋亡、病毒感染等通路发挥作用,可以作为抗PDCoV感染的潜在治疗药物进一步研究。

来源:2022年第11期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2022年第11期

联系我们

  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 电话:010-62815987
  • E-mail:xmsyxb@caas.cn

咨询工作人员