畜牧兽医学报

作者：袁娇, 徐国强, 周翔, 徐三平, 李胜, 黎望明, 刘榜

单位：1. 华中农业大学动物科学技术学院, 武汉 430070;2. 华中农业大学 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 武汉 430070;3. 生猪健康养殖省部共建协同创新中心, 武汉 430070;4. 湖北省地方猪品种改良工程技术研究中心, 武汉 430070;5. 通城县国营种畜场, 通城 437400

关键词：通城猪,保种,群体结构,遗传多样性

基金：国家自然科学基金重点项目（31930104）

旨在基于SNP芯片信息分析通城猪保种群的群体结构和遗传多样性，对保种效果进行监测。本研究利用“中芯一号”50K SNP芯片对68头通城猪的全基因组SNP进行扫描，通过以下两方面评估保种效果：1）群体结构。通过群体分层、遗传距离、亲缘关系以及公猪基因组家系等分析，研究通城猪个体间的群体结构；2）遗传多样性。估算等位基因频率、有效等位基因数、多态信息含量、多态性标记比例、杂合度、核苷酸多样性等多态性和杂合性相关参数估计遗传多样性，分析有效群体含量和连续性纯合片段（runs of homozygosity，ROH），综合评估保种效果。结果显示：1）保种群无明显分层，遗传距离为0.27，亲缘系数为0.17；2）基因组等位基因频率为0.77，有效等位基因数为1.52，多态信息含量均值为0.31，多态性标记比例为88.28%，观测杂合度为0.32，期望杂合度为0.31；20世代前通城猪有效群体含量为105头，当前世代有效群体含量为94头；ROH共计有184个，平均ROH长度为23.71 Mb，其中28.80%的长度在15~20 Mb之间；基因组近交系数为0.04%，具较低水平的近交程度。通城猪保种群是一个没有分层的纯种群体，具有丰富的遗传多样性，得到了有效保护。

来源：2022年第8期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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