畜牧兽医学报

作者：许李锋, 贾晨宇, 陈福再, 方梦园, 刘孝丹, 陈吉龙, 李训良

单位：福建农林大学动物科学学院(蜂学学院), 福建省畜禽病原感染与免疫学重点实验室, 福建省-尼泊尔畜禽重大疫病防控联合实验室, 福州 350002

关键词：鸡滑液囊支原体,分离鉴定,全基因组测序,基因功能注释分析

基金：福建省自然科学基金（2020J05025）；福建省中青年教师教育科研项目（JAT200093）；省级大学生创新创业训练计划项目（S202110389053）

鸡滑液囊支原体（Mycoplasma synoviae，MS）能引起家禽呼吸道疾病、传染性滑膜炎、蛋壳顶端异常及生长迟缓等，给全球养禽业带来巨大的经济损失。然而不同国家和地区MS的耐药性和致病性存在差异，因此本研究旨在挖掘福建MS菌株的特征。作者采集福建省疑似患MS的病鸡关节腔内容物，对菌株进行分离鉴定，并利用三代联合二代测序技术对其进行全基因组测序。结果显示，该分离株病原特性稳定，已保藏至中国典型培养物保藏中心，保藏编号为CCTCC No.：M 2021210，并将其命名为MS-FJ01。MS-FJ01基因组全长为795 381 bp，GC含量为28.39%；预测编码基因数为704个，占整个基因组的90.48%；并在COG、GO和KEGG数据库分别注释到476、382、425个基因。通过各数据库的分析，注释了40个耐药相关基因，4个碳水化合物相关酶基因，136个病原与宿主互作相关基因，47个毒力因子相关基因，106个膜转运蛋白相关基因，25个限制修饰相关基因。通过与MS HN01和MS 5-9基因组进一步比较发现，MS-FJ01与这两个中国菌株均存在良好的共线性关系，且与MS 5-9的亲缘关系更近。本研究阐明了福建MS菌株的基因组结构、通过相关数据库的分析，预测和注释了其基因的功能，为深入研究MS提供参考依据。

来源：2022年第8期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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