畜牧兽医学报

作者：张兰, 姚一凡, 覃安琪, 李睿, 张伊阳, 陈树吾, 许瑾, 乔自林, 杨琨

单位：1. 西北民族大学生命科学与工程学院, 兰州 730030;2. 甘肃省动物细胞技术创新中心, 兰州 730030;3. 西北民族大学生物医学研究中心, 兰州 730030

关键词：牦牛,PASMCs,低氧与常氧,TMT技术

基金：国家自然科学基金(31860687)；甘肃省自然科学基金(21JR11RA024)；中央高校创新团队项目(31920200004)；教育部动物医学生物工程创新团队(IRT-17R88)

旨在利用串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)技术对牦牛肺动脉平滑肌细胞(pulmonary arterial smooth muscle cells,PASMCs)在低氧和常氧不同培养条件下的蛋白组学进行差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs)分析，进而了解高原牦牛PASMCs的DEPs。本试验采用贴壁培养法培养PASMCs，分别在低氧与常氧条件下培养72 h，然后收集细胞，提取两组细胞的总蛋白，利用TMT标记蛋白定量技术筛选DEPs进行分析，并进行GO功能注释和KEGG通路分析。在比较低氧和常氧下PASMCs的2组蛋白样品中共获得6 859个蛋白，以FC (fold change)≥1.3或≤0.78，且P<0.05条件进行筛选，获得DEPs共531个，其中上调DEPs有186个，下调DEPs有345个。富集分析结果表明，DEPs主要富集在中枢碳代谢、糖酵解与糖代谢合成、HIF-1信号通路、次生代谢产物的生物合成等低氧适应相关通路中。在这些通路中发现其中有7个重要的DEPs (PGK、HK、LDH、PGAM、pfkA、IL6ST、PDK1)。亚细胞定位中质膜(28.9%)所占比例最高。结构域分析中主要以表皮生长因子样结构域为主。结果表明，DEPs分别富集在代谢、酶活性、低氧适应性等相关类别与通路中，并发现7个重要的DEPs (PGK、HK、LDH、PGAM、pfkA、IL6ST、PDK1)可能与缺氧环境的适应有关。这些结果为进一步研究牦牛PASMCs在低氧中的适应性提供了理论支持。

来源：2022年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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