畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2022年第5期:猪流产胎儿中猪圆环病毒3型的检测及其遗传演化分析

发布日期:

作者:何庆, 李周勉, 王欢, 李丹彤, 谭庆辉, 邹亚文, 苏建明, 邓治邦, 杨毅, 王乃东

单位:1. 湖南农业大学动物医学院 兽用蛋白质工程疫苗湖南省重点实验室 兽用疫苗逆向创制湖南省工程研究中心, 长沙 410128;2. 长沙市望城区高塘岭街道农业农村综合服务中心, 长沙 410128;3. 娄底市动物疫病预防控制中心, 娄底 417000

关键词:猪圆环病毒3型,全基因组,Cap,遗传演化分析

基金:国家自然科学基金(32172844);湖南省自然科学基金面上项目(2018JJ2177);湖南农业大学“双一流”建设项目(SYL2019048)

旨在分析猪流产胎儿中猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)的感染及其遗传进化情况。对2015—2017年采集的湖南省680份猪流产胎儿病料样品进行PCV3检测、扩增和测序,并利用生物信息学软件对获得的序列进行遗传进化分析。结果显示,猪流产胎儿样品中PCV3阳性率为24.4%(166/680),其中,2015—2017年阳性率分别为18.2%(26/143)、22.7%(54/238)和28.8%(86/299)。从PCV3阳性样本中获得了1株PCV3基因组全长序列,命名为PCV3/CN/Hunan-57(GenBank序列登录号为MZ934695),与国内外毒株基因组序列相比,相似性为97.8%~99.2%;获得了5株PCV3 ORF2基因序列,它们的核苷酸和氨基酸相似性为97.5%~98.3%和96.7%~99.7%,与国内外参考毒株ORF2基因序列相比,其核苷酸和氨基酸相似性为96.3%~99.2%和96.8%~100%。基于ORF2基因序列构建遗传进化树和进行多重序列比对,发现获得的PCV3阳性序列分别属于PCV3a(1株)和PCV3c(4株),并鉴定出T100A、G113S和A184S突变位点。综上表明,猪流产胎儿中PCV3感染率较高,且存在不同类型的PCV3毒株感染,为后续深入研究PCV3遗传变异及其相关致病性提供了重要参考信息。

来源:2022年第5期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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