畜牧兽医学报

作者：刘芳君, 蓝吴涛, 马悦悦, 李鹏飞, 张磊, 朱芷葳

单位：1. 山西农业大学生命科学学院, 太谷 030801;2. 忻州师范学院, 忻州 034000

关键词：生物信息学,miR-148a-3p,表达,功能,癌症

基金：国家自然科学基金（31402156）；山西省重点研发计划项目（201803D31062）；山西农业大学青年拔尖创新人才支持计划（TYIT201403）

旨在研究小鼠不同组织中miR-148a-3p的表达情况，并对其进行生物信息学分析，构建miR-148a-3p基因相关网络，进一步阐明其在机体中的作用。本研究以6周龄雄性C57BL/6 J小鼠胃、肺、脾、皮肤、肝、心和肾7个组织为研究材料，每组3个重复，进行3次平行试验。利用qRT-PCR技术比较小鼠不同组织中miR-148a-3p的表达水平。在miBase上对miR-148a-3p在不同物种间的保守性进行分析，并通过Promoter Scan和TRANSFAC预测其转录因子结合位点。利用TargetScan、PicTar和miRanda预测miR-148a-3p的靶基因并取交集，并进行GO和KEGG分析。利用Cytoscape构建TF-miRNA-mRNA互作网络。qRT-PCR结果显示，在所有组织中，miR-148a-3p在脾中的表达水平最高（P<0.001），肝次之（P<0.001），在皮肤、胃、心、肾、肺中的表达水平逐渐降低。经预测bata-pol、CREB、E4F1、NF-S等多个转录因子可以与miR-148a-3p结合并调控其表达。GO富集和KEGG通路分析表明，miR-148a-3p的靶基因主要参与离子转运、乙酰胆碱激活的阳离子选择性通道活性、构成细胞质膜等功能；并参与TGF-β、肥厚性心肌病和黏附连接等通路。由70个点和70条边构成了TF-miRNA-mRNA互作网络，包含5个转录因子和63个mRNAs。结果表明，miR-148a-3p在小鼠脾组织中高表达且受到多种转录因子调控，与癌症发展密切相关。

来源：2022年第2期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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