畜牧兽医学报

作者：吴祎程, 冉涛, 周传社, 谭支良

单位：1. 中国科学院亚热带农业生态研究所 亚热带农业生态过程重点实验室 畜禽养殖污染控制与资源化技术国家工程实验室 湖南省动物营养与生理代谢实验室 农业部中南动物营养与饲料科学观测站, 长沙 410125;2. 中国科学院大学, 北京 100049;3. 兰州大学草地农业科技学院, 兰州 730020

关键词：瘤胃,病毒,噬菌体,宏基因组,高通量测序

基金：国家自然科学基金（U20A2057；31772632）；国家重点研发计划（2018YFD0501903；2017YFD0500500）；兰州大学“双一流”建设人才项目（561120213）

病毒（virus）存在于各种动物胃肠道中，反刍动物瘤胃也不例外。瘤胃是一个复杂且多样的微生态系统，包括细菌、真菌、原虫、古生菌和病毒等多种微生物。目前，多组学技术和生物信息学分析手段被广泛用于瘤胃细菌群落的研究。有研究表明，饲粮、环境及宿主基因型会对瘤胃细菌多样性和菌群结构产生影响；瘤胃细菌也会反过来影响宿主机体代谢、生长发育和健康状况。与瘤胃细菌相比，瘤胃病毒受到的关注相对较少。随着分子生物学技术的发展，高通量测序技术为病毒组学的研究提供了必要的支持。研究者们将宏基因组学运用于瘤胃病毒，在瘤胃液中发现了许多新型病毒，极大地丰富了人们对瘤胃病毒多样性的认知。本文从瘤胃噬菌体概念出发，重点阐述了瘤胃病毒DNA提取、测序及生物信息学分析手段，并结合其他环境病毒的研究方法进行探讨，最后对瘤胃病毒宏基因组研究的应用前景进行了总结。

来源：2022年第1期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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