畜牧兽医学报

作者：朱静静, 戴政列, 汪涵, 李向臣, 赵阿勇, 周晓龙, 杨松柏

单位：浙江农林大学动物科技学院·动物医学院, 临安 311300

关键词：猪,乙型脑炎病毒,先天免疫反应,PK15细胞,高通量测序

基金：浙江省自然科学基金（LY19C170003）；浙江省重点研发计划（2021C04034）

旨在分析乙型脑炎病毒（Japanese encephalitis virus，JEV）感染猪肾上皮细胞PK15后的lncRNA差异表达谱，探究宿主lncRNA在JEV感染和宿主防御中的潜在功能。本研究中利用JEV感染PK15细胞，感染36 h，收集细胞，同时设立未感染对照组，每组3个生物学重复。提取细胞总RNA，构建cDNA文库后进行高通量测序，筛选出差异表达lncRNA。通过对差异表达lncRNA与mRNA的位置关系以及序列相似性预测顺式和反式作用的靶基因，将预测的靶基因进行GO和KEGG分析。最后随机选出9个差异表达lncRNAs，利用实时荧光定量PCR （quantitative reverse transcription PCR，qRT-PCR）技术进行表达验证。结果表明，本研究中共鉴定出856个差异表达lncRNAs，其中452个lncRNAs显著上调表达，404个lncRNAs显著下调表达。GO分析发现，lncRNA的靶基因主要富集于先天性免疫反应；KEGG通路分析发现lncRNA的靶基因显著富集于肿瘤坏死因子、Toll样受体和NF-κB等信号通路。通过qRT-PCR验证发现，定量结果和测序结果基本一致。本研究为进一步探究lncRNA参与宿主免疫反应调控JEV复制奠定了理论基础。

来源：2022年第1期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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