畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2021年第11期:鸭甲型肝炎病毒1型与3型双重TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用

发布日期:

作者:林梦舟, 吴双, 徐建生, 谢军, 吴植, 姜勇, 朱善元

单位:1. 扬州大学兽医学院, 扬州 225009;2. 江苏农牧科技职业学院 江苏省兽用生物制药高技术研究重点实验室, 泰州 225300;3. 江苏立华牧业股份有限公司, 常州 213000

关键词:1型鸭肝炎病毒,3型鸭肝炎病毒,鸭病毒性肝炎,实时荧光定量PCR

基金:江苏高校“青蓝工程”项目[苏教师函(2020)10号];“六大人才高峰”项目(NY-009);江苏省农业科技自主创新资金项目[CX (18)1004];江苏省高校优秀科技创新团队项目[苏教科函(2019)7号]

旨在建立一种针对鸭甲肝病毒1型(DHAV-1)和鸭甲肝病毒3型(DHAV-3)的高效快速、高灵敏度和高特异性的双重TaqMan实时荧光定量PCR (q-PCR)检测方法并应用于临床疑似样品检测。根据DHAV-1和DHAV-3的VP1基因保守区域,分别设计合成了2对特异性引物和探针,在此基础上建立并优化了双重TaqMan实时荧光定量PCR方法。结果显示:优化后标准曲线的相关系数(R2)均在0.999以上,扩增效率(E)在105%~110%,其组内变异系数(i-CV)与组间变异系数(c-CV)均在0.77%以下。运用双重q-PCR方法对不同稀释度的混合质粒与病毒核酸进行检测,结果表明,建立的双重TaqMan q-PCR特异性高;同时检测DHAV-1和DHAV-3的灵敏度均可达10个拷贝,分别是常规PCR方法的1 000倍和100倍。对40份来自苏中、苏北地区的疑似鸭肝炎病毒感染的鸭组织病料进行检测,结果表明,q-PCR方法检出36份阳性病料,阳性率为90%;而常规PCR方法未能检出高Ct值的样品,阳性率为72.5%(29份阳性病料)。建立的双重TaqManq-PCR检测方法为DHAV-1与DHAV-3的临床样品检测提供了高效、灵敏、特异的工具,推动了临床分子流行病学调查及病毒定量分析等研究。

来源:2021年第11期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2021年第11期

联系我们

  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 电话:010-62815987
  • E-mail:xmsyxb@caas.cn

咨询工作人员