畜牧兽医学报

作者：张瑞, 马钧, 陈燕, 张天留, 范婷婷, 朱波, 张路培, 徐凌洋, 高会江, 李俊雅, 高雪

单位：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 牛遗传育种创新团队, 北京 100193

关键词：牛亚科,串联重复序列,卫星DNA,进化

基金：国家自然科学基金面上项目（31572376）

旨在研究牛亚科物种间串联重复序列（tandem repeats sequence，TRs）的分布特点及着丝粒区卫星DNA的进化关系。本研究基于普通牛、瘤牛、牦牛、水牛、野牛、独龙牛6个牛亚科物种的基因组序列，研究了不同物种间TRs的组成、分布及结构特点，并分析了6个牛亚科物种染色体着丝粒区卫星DNA的进化关系。结果表明：1）TRs在牛亚科物种中平均占比为2.03%，平均长度54.93 Mb，其中普通牛的占比最高3.42%（93.00 Mb），瘤牛最低1.42%（37.88 Mb）。2）微卫星DNA在3类TRs中位点数最多，为483 405，占TRs总位点数85.64%，高于小卫星DNA（43 026，7.62%）和卫星DNA（38 180，6.75%）。3）通过对微卫星DNA丰度和平均长度分析发现，二碱基微卫星DNA在牛亚科物种中丰度最高，为70.93 loci/Mb，且以AC拷贝类别为主。4）通过构建着丝粒区1.715和1.723卫星DNA的系统发育树发现，1.715卫星DNA普遍存在于牛亚科物种的基因组中，而1.723卫星DNA在牦牛中不存在，两类卫星DNA在不同物种间或不同染色体上存在不同程度分化，具有较明显的种间特异性。TRs在牛亚科6个物种中平均占比为2.03%，微卫星DNA为TRs主要序列，且二碱基微卫星丰度最高，并以AC拷贝类别为主；1.715卫星DNA普遍存在于6个牛亚科物种的基因组中，但在物种间或染色体间存在不同程度分化。本研究结果为牛亚科物种间TRs分布特征及进化关系研究提供了重要理论依据。

来源：2021年第10期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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