畜牧兽医学报

作者：曹慧, 杨丹娇, 张敏, 李平, 张朝辉, 汤承, 张斌

单位：1. 西南民族大学畜牧兽医学院, 成都 610041;2. 国家民族事务委员会青藏高原动物疫病防控创新团队, 成都 610041;3. 四川省甘孜藏族自治州畜牧业科学研究所, 康定 626000;4. 四川省甘孜藏族自治州动物疫病预防控制中心, 康定 626000

关键词：四川藏猪,戊型肝炎病毒,基因组,遗传分析

基金：四川应用基础研究计划（2020YJ0247）；甘孜州藏猪戊型肝炎病毒（HEV）的流行病学及安全生产综合防控技术研究（20YYJS0030）；国家自然科学基金（31772766）；西南民族大学研究生创新型科研项目（CX2020SZ53）

旨在调查四川地区藏猪戊型肝炎病毒（hepatitis E virus，HEV）的流行情况和遗传演化，作者用RT-PCR法对2018—2020年采集自四川省甘孜藏族自治州和阿坝藏族自治州的22个藏猪场332份藏猪粪便样本进行HEV检测，并对阳性样本进行基因分型。RT-PCR检测结果表明HEV核酸阳性率为20.48%（68/332，95% CI=16.3%~25.2%），22个规模藏猪场中HEV猪场阳性率为77.27%（17/22，95% CI=54.6%~92.2%），健康样本阳性率为2.86%（3/105，95% CI=0.6%~8.1%），腹泻样本阳性率为28.63%（65/227，95% CI=22.8%~35.0%），系统进化分析显示所有阳性株均为G4型。为了进一步研究该地区流行毒株的演化过程，以贝叶斯进化分析软件进行分歧时间估算，结果表明，藏猪流行毒株的分歧时间最早为1999年，最晚为2016年。并分别从每年的样本中挑选1份阳性样本得到全基因组序列，核酸序列相似性为89.5%~93.1%。通过对3条全基因组重组分析发现SWU/301/2019存在重组现象，SWU/301/2019重组区域位于ORF1的3 746—4 655 bp。本研究首次对四川地区藏猪源HEV进行调查，结果表明四川藏猪中存在一定程度的HEV感染，为四川地区对藏猪感染HEV的防治以及深入研究四川藏猪源HEV遗传变异及生物学特性提供了参考依据。

来源：2021年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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