畜牧兽医学报

作者：彭雅鑫, 刘军, 赵诗瑜, 徐在言, 左波

单位：1. 华中农业大学 农业部猪遗传育种重点实验室, 武汉 430070;2. 华中农业大学动物医学院 基础兽医系, 武汉 430070

关键词：RXRB,关联分析,连锁不平衡,单倍型,生长育肥,繁殖性状,猪

基金：湖北省科技重大专项；湖北省自然科学基金创新群体（2018CFA015）；湖北省农业科技创新中心创新团队；国家科技支撑计划（2014BAD20B01）

旨在研究猪RXRB基因多态性位点，并筛选与猪生长育肥和繁殖性状显著相关的SNPs，为种猪的遗传改良提供新的遗传标记位点。本研究通过采集962头健康大白猪（美系大白459头，法系大白503头）的血液DNA，利用直接测序法和PCR-RFLP技术分别检测两个品系大白猪RXRB基因SNP位点，并进行遗传多态性分析。利用SAS 8.0软件中的混合线性模型（Mixed）对RXRB基因SNP位点与表型性状值进行关联分析。利用Haploview 4.2软件对RXRB基因SNP位点进行连锁不平衡分析。结果显示，在两个品系大白猪群中共检测到10个SNPs，其中，美系大白有5个SNPs，法系大白有5个SNPs。经X2适合性检验，该10个SNPs在大白猪群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。关联分析结果表明，rs340542491、rs330162688和rs326226767与达100 kg体重日龄达到显著相关（P0.33），rs330162688-rs324141460处于完全连锁状态（D’=1），rs324141460-rs340542491处于完全连锁状态（D’=1），单倍型组合关联分析结果与单个SNP关联分析结果一致，单倍型组合与达100 kg体重日龄、活体背膘厚、初生重和乳头数等性状存在极显著（P<0.01）或显著（P<0.05）相关；在法系大白中，rs691889709-rs323107853处于完美连锁状态（D’=1，r2=1），单倍型组合关联分析结果显示，单倍型组合与体长和乳头数达到极显著（P<0.01）或显著（P<0.05）相关。以上结果提示，RXRB基因内的10个SNPs可以作为猪育种改良的分子标记，同时对深入研究该基因功能具有一定的参考意义。

来源：2021年第3期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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