畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2021年第2期:湖羊PLAG1基因5'调控区多态性及其与早期体重的关联分析

发布日期:

作者:郭潇潇, 李隐侠, 王悦, 张含, 张俊, 钱勇, 孟春花, 王慧利, 仲跻峰, 曹少先

单位:1. 南京农业大学动物科技学院, 南京 210095;2. 江苏省农业科学院畜牧研究所, 南京 210014;3. 江苏省农业种质资源保护与利用平台, 南京 210014

关键词:湖羊,PLAG1基因,5'调控区,SNPs,初生体重,断奶体重

基金:江苏省重点研发计划(现代农业)重点项目(BE2019373);江苏省农业科技自主创新资金(CX(18)3004)

旨在克隆湖羊PLAG1基因5'调控区序列,明确PLAG1基因5'调控区多态性与湖羊早期体重的关系,寻找用于湖羊生长性状辅助选择的分子标记。本研究利用5'RACE技术鉴定PLAG1基因转录起始位点,以456只断奶湖羊为对象,利用测序法筛选PLAG1 5'调控区SNP位点,使用SPSS 18.0软件分析不同基因型对湖羊初生体重和断奶体重的影响。结果表明,PLAG1基因转录起始位点均位于g.30535位点,测序发现,PLAG1基因5'调控序列存在15个SNPs位点,在湖羊群体中均有3种基因型,均处于Hardy-Weinberg平衡状态。关联分析发现,g.28888A>T位点AA型、g.28901G>T位点GG型、g.30802C>T位点CC型、g.30825A>G位点AA型的初生体重均显著大于相应的杂合基因型(PC位点CC型断奶体重显著小于TC型(PT、g.28901G>T、g.28913T>A、g.29717G>C、g.29724A>C、g.29725G>A、g.29768T>C、g.29771A>G、g.30141T>A、g.30144A>G、g.30691C>A、g.30694A>T、g.30737T>C、g.30802C>T、g.30825A>G,15个位点连锁且有18种单倍型。将样本量较多的5种单倍型与湖羊早期体重进行关联分析发现,AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA单倍型初生体重显著大于ATGTTAGCACGATCAGTAAGCAATTCCTAG单倍型(PT、g.28901G>T、g.30802C>T、g.30825A>G位点与初生体重显著相关(PC位点与断奶体重显著相关(P<0.05),AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA单倍型与初生体重和断奶体重显著相关(P<0.05),说明PLAG1基因可作为湖羊生长性状选择的候选遗传标记。

来源:2021年第2期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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