畜牧兽医学报

作者：李宁, 郭慧芳, 王白玉, 乔麒龙, 黄庆, 李永涛, 王增, 赵军

单位：河南农业大学牧医工程学院, 郑州 450046

关键词：塞内卡病毒A,RT-PCR扩增,SVACH-HNCY-2019,基因组序列分析,遗传进化

基金：国家重点研发计划资助项目（2016YFD0501100）

旨在分析塞内卡病毒A型（Senecavirus A，SVA） CH-HNCY-2019株的基因组特性和演化，参考SVA毒株SVV-001（GenBank No.NC011349）全基因组序列设计8对引物，通过RT-PCR扩增和测序获得SVA CH-HNCY-2019株全基因序列并进行序列分析。结果显示，SVA分离株CH-HNCY-2019基因组全长为7 294个核苷酸，与中国分离株核苷酸相似性为95.9%~99%，与美国经典株SVV-001核苷酸相似性最低。CH-HNCY-2019与大多数中国2017—2018年分离毒株亲缘关系较近，处于同一分支，而与中国2015—2016年分离株亲缘关系较远。与包括2019年中国广东4个SVA分离株在内的其他国内外分离株相比，CH-HNCY-2019的VP1蛋白的722位氨基酸由L突变为Q；VP3蛋白的499位氨基酸由A突变为V，528位氨基酸由P突变为S，582位氨基酸由E突变为K。本研究成功获得1株SVA CH-HNCY-2019全基因组序列，研究结果提示，SVA中国流行株具有多样性，而且在不断地演变，应加强SVA的分子流行病学调查、生物安全措施和疫苗研发以防止SVA在我国猪群中的广泛传播。

来源：2021年第2期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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