畜牧兽医学报

作者：朱春红, 陶志云, 刘宏祥, 宋卫涛, 章双杰, 徐文娟, 原志伟, 李慧芳

单位：1. 江苏省家禽科学研究所, 扬州 225125;2. 中华人民共和国荣成海关, 荣成 264300

关键词：16SrRNA测序,菌群,肠道,拟杆菌,鸭

基金：江苏省农业重大新品种创制项目（PZCZ201736）；国家重点研发计划（2018YFD0501504）；江苏省属公益类科研院所自主科研（BM2018026）

旨在分析健康鸭十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物菌群组成、多样性特征以及拟杆菌分布。本研究选择健康高邮鸭20只，公母各半，70日龄时无菌采集十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物，提取肠道内容物细菌基因组，利用IonS5TMXL平台进行高通量测序，分析肠道内容物菌群结构与丰度特征以及拟杆菌的分布。结果表明，十二指肠、空肠内容物菌群丰度显著高于回肠和盲肠内容物（P<0.05），回肠内容物菌群多样性最低；十二指肠和空肠内菌群群落结构较为相似，与回肠，特别是盲肠的相似度较小。健康鸭肠内优势菌门为拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和梭杆菌门（Fusobacteria），上述菌门在各肠段内容物中相对丰度不同；不同肠段内容物中定植了不同差异微生物物种，十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物中差异菌门分别是变形菌门、放线菌门（Actinobacteria）、厚壁菌门和拟杆菌门。鸭肠道中共分析到28种拟杆菌种，其中B.acidifaciens、B.barnesiae、B.caccae、B.caecicola、B.coprocola、B.sp和B.luti在盲肠内容物中显著聚类，且B.caecigallinarum、B.plebeius和B.barnesiae在鸭盲肠中优势定植。结果显示，鸭肠段空间显著影响了其内容物中菌群丰度与多样性，不同肠段内定植了差异的优势微生物物种，这可能与肠段小环境以及功能一致，在盲肠内容物中优势定植拟杆菌，推测可能与鸭盲肠生理生化功能相关。

来源：2020年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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