畜牧兽医学报

作者：董林松, 谈成, 蔡更元, 吴珍芳

单位：1. 温氏食品集团股份有限公司, 新兴 527400;2. 华南农业大学动物科学学院 国家生猪种业工程技术研究中心, 广州 510642

关键词：基因组选择,预测可靠性,育种策略,种猪

基金：广东省自然科学基金（2018B030313011）；中国博士后科学基金资助项目（2019M653093）

目前，基因组选择（genomic selection，GS）技术已经在种猪育种中开展，但为获得较高的收益，还需研究一些应用策略，如确定仔猪基因分型个体比例和早期仔猪留种比例。本试验选择温氏集团出生于2011—2016年的大白种猪作为研究对象，共有超过4.5万条的生长测定记录，超过7万条繁殖记录，和2 090个个体的简化基因组测序（GBS）数据，其中，出生于2016年7~12月的440个体作为候选群体。研究性状包括两个生长性状（校正100 kg日龄和校正100 kg背膘厚）和一个繁殖性状（总产仔数）。为对比预测效果，在候选群体进行育种值预测时，按照是否利用其基因型或表型信息分为4种预测方案，比较不同方案的预测可靠性和个体选择指数的排名情况。结果显示，在预测候选群育种值时，利用其表型或基因型信息均比不利用时的预测结果更加可靠。对生长性状终测前、后进行基因组选择指数计算，发现，终测后指数排名前30%的个体都位于终测前指数排名前60%内。若仔猪出生后仅选择常规BLUP预测指数排名前60%的个体，会导致有接近15%的具有优秀潜力的个体被遗漏。本研究建议，对所有新生健康仔猪都进行基因分型并计算基因组选择指数，然后对指数排名靠前60%的个体进行性能测定。

来源：2020年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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