畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2020年第9期:西藏高原藏猪盲肠微生物群落结构与多样性的研究

发布日期:

作者:谭占坤, 商振达, 刘锁珠, 商鹏, 强巴央宗

单位:1. 西藏农牧学院高原生态研究所, 林芝 860000;2. 西藏农牧学院动物科学学院, 林芝 860000;3. 西藏高原饲料加工工程研究中心, 林芝 860000

关键词:放牧藏猪,舍饲藏猪,DLY猪,盲肠微生物群

基金:2019年度西藏农牧学院研究生创新计划项目(YJS2019-24);中央财政支持地方高校发展专项资金(ZZXT2019-02);2019年西藏自治区厅校联合基金重点项目(XZ2019ZRG-55Z);西藏高原饲料加工工程研究中心项目(XZJYT2018GCZX)

本研究旨在探讨西藏高原放牧藏猪、舍饲藏猪与瘦肉型猪(杜×长×大,DLY猪)盲肠微生物的群落组成及多样性,从而部分揭示西藏高原藏猪肠道微生物的特异性。选用日龄相近的放牧藏猪、舍饲藏猪及DLY猪各5头,放牧藏猪由林芝本地农牧民采用传统方式放牧养殖,舍饲藏猪及DLY猪圈养并饲喂相同饲粮,160日龄时前腔静脉放血屠宰,采集盲肠食糜于液氮速冻待测。采用高通量测序技术测定样品16S rRNA V3-V4区域的基因序列。结果表明,在15个样本的16S rRNA基因V3-V4区测序共获得了659 904条有效序列,其中放牧藏猪213 031条、舍饲藏猪219 417条、DLY猪227 456条。放牧藏猪盲肠微生物OTU总数、Chao1指数、ACE指数及香农(Shannon)指数均显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P0.05)。3个类型猪盲肠微生物共划分为13个门,56个属。厚壁菌门(Firmicutes)是3个类型猪相对丰度共同最高的门。放线菌门(Actinobacteria)与疣微菌门(Verrucomicrobia)在放牧藏猪中相对丰度显著高于其他2个类型猪(P<0.05),舍饲藏猪拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度显著高于放牧藏猪与DLY猪(P<0.05);放牧藏猪共有11个属相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P<0.05)。结果提示,放牧藏猪盲肠微生物群落结构与多样性具备自身独特性,为进一步开发藏猪资源提供参考。

来源:2020年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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