畜牧兽医学报

作者：孙倩, 王琪, 黄金秀, 齐仁立, 杨飞云, 王瑞生, 兰云贤

单位：1. 西南大学动物科学学院, 重庆 402460;2. 重庆市畜牧科学院, 重庆 402460;3. 农业部养猪科学重点实验室, 重庆 402460

关键词：罗伊氏乳杆菌,miRNA,Solexa高通量测序,空肠,仔猪

基金：国家自然科学基金青年科学基金项目（31702151）；重庆市财政专项资金项目（19513）；重庆市百千万工程领军人才培养计划（19234）

试验旨在研究罗伊氏乳杆菌对仔猪空肠miRNAs表达的影响。选用1日龄健康约克×荣昌仔猪6窝，随机分为两组，每组3窝（共27头）。即对照组（每天每头灌喂0.1%的无菌蛋白胨溶液），LR组（每天每头灌喂活菌总数为1.0×1010CFU的罗伊氏乳杆菌），分别在10和20日龄，每组选取6头进行屠宰，采集空肠样品。通过Solexa高通量测序技术检测空肠miRNA的表达谱，利用生物信息学技术进行靶基因预测和功能分析。结果显示：1）试验构建了8个文库，共获得187 103 840条纯净reads序列，其中22 nt长度序列占的比例最大；2）10和20日龄分别鉴定出354和352个已知的miRNAs，其中有329个miRNAs共表达；3）灌喂罗伊氏乳杆菌组仔猪空肠miRNA差异表达，10和20日龄分别获得7和9个差异显著的miRNAs，ssc-miR-218在两个日龄中都差异表达；4）对差异表达的miRNAs进行靶基因预测和KEGG通路分析，发现有10 221个靶基因富集到293条通路上，有66条通路显著富集（P<0.05），包括与肠道发育及免疫调控相关的MAPK和PI3K-Akt信号通路；5）随机挑选6个差异表达miRNAs进行荧光定量PCR验证，验证结果与测序结果基本一致。本研究表明，罗伊氏乳杆菌可能通过影响空肠miRNAs表达来调控有关肠道健康的信号通路。

来源：2020年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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