畜牧兽医学报

作者：王洪洋, 张莺莺, 涂尾龙, 吴华莉, 曹建国, 谈永松

单位：1. 上海市农业科学院畜牧兽医研究所, 上海 201106;2. 上海种猪工程技术研究中心, 上海 201302

关键词：陆川猪,连续性纯合片段,基因组纯合度,生产性状

基金：上海市市级农口系统青年人才成长计划（沪农青字（2018）第1-24号）；上海市科委实验动物项目（18140900501）；国家自然科学基金（31900416）

旨在探讨高度近交陆川猪的遗传稳定性。本试验采集20头近交和6头非近交陆川猪的耳组织样品进行个体基因组重测序，通过扫描全基因组SNPs分析近交陆川猪群体的遗传多样性，并基于基因组纯合度挖掘近交陆川猪群体中特异的纯合区域（region of homozygosity，ROHs）及相关基因。结果表明，近交陆川猪群体的观察杂合度（0.373）小于期望杂合度（0.491），推测其发生了选择或者近交；系统进化树和群体遗传结构分析发现，近交陆川猪群体在近交过程中分化成为两个近交家系，且230、236、239、132、130及126号个体亲缘关系最近；在近交群体中，基因组纯合度和基因组长纯合片段比例的均值分别为59.64%和0.12，都极显著高于非近交群体53.18%和0.05（P<0.01），说明该近交陆川猪群体已达到高度近交；近交群体和非近交群体中分别有1 250和633个ROHs，重叠分析结果显示，特异存在于近交群体中的阳性纯合区域（positive region of homozygosity，pROHs）有224个，其中由于近交产生的纯合突变可能影响参与激素合成过程、胰液分泌、膜脂代谢过程、IgA产生的肠道免疫网络及纹肌细胞分化等相关的1 322个基因。结果提示，近交陆川猪群体的遗传多样性低、基因组纯合度高且已达到高度近交，说明该群体的遗传稳定性高。此外，近交陆川猪群体在近交过程中产生的纯合突变可能与机体的免疫、生长等生产性状相关。

来源：2020年第8期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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