畜牧兽医学报

作者：张大俊, 侯景, 申超超, 徐国伟, 孔汉金, 成伟伟, 郑海学, 刘湘涛, 张克山

单位：中国农业科学院兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室, 国家口蹄疫参考实验室, 兰州 730046

关键词：羊传染性脓疱病毒,山羊皮肤成纤维细胞,病毒感染,差异表达miRNA

基金：国家重点研发计划（2018YFD0502100）

旨在研究羊传染性脓疱病毒（orf virus，orfv）感染山羊皮肤成纤维细胞（goat skin fibroblasts cell，GSF）对GSF细胞microRNA（miRNA）表达谱影响，探究miRNA在orfv感染过程中的作用及调控机制。分别提取感染和未感染orfv的GSF细胞总RNA，构建miRNA文库，利用高通量测序技术进行miRNA差异表达分析，对差异表达miRNA靶基因进行预测，并进行GO和KEGG分析，随机选取10个差异miRNA进行RT-qPCR验证。结果显示，orfv感染组和未感染GSF细胞组相比共有678个显著差异表达的miRNA（fold change≥1.5），其中，上调表达miRNA有509个，下调表达miRNA有169个，uniq_miRNA的Venn图分析显示，感染组和对照组共有的miRNA仅占8.21%；GO和KEGG分析显示，差异表达miRNA主要参与脂质代谢、受体及细胞因子信号转导等细胞生物学过程，RT-qPCR验证结果与高通量测序结果一致。本研究结果表明，orfv感染GSF细胞对其编码的miRNA有显著影响，获得大量GSF细胞编码的与orfv感染相关的差异miRNA，为进一步从宿主miRNA层面揭示orfv感染和致病机制提供了参考依据。

来源：2020年第8期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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