畜牧兽医学报

作者：郭振华, 阮海宇, 耿瑞, 陈鑫鑫, 乔松林, 邓瑞广, 张改平

单位：1. 河南省农业科学院动物免疫学重点实验室 农业部动物免疫学重点实验室, 郑州 450002;2. 河南农业大学, 郑州 450002

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒,同源性分析,系统进化树,遗传变异,基因重组

基金：国家重点研发计划（2016YFD0500709）；国家生猪产业技术体系专项基金项目（CARS-36）；河南省农业科学院科研发展专项资金项目（2019CY01）

旨在分析本实验室2017年从临床病料中分离的1株猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV）的分子遗传特征，测定了其全基因组序列，并运用生物信息学软件对其遗传特点进行了分析。结果显示，该毒株基因组全长15 054 bp，与代表性毒株VR-2332、NADC30、CH-1a、JXA1和QYYZ的核苷酸相似性分别为84.5%、93.4%、84.2%、83.9%和82.1%。系统进化树分析显示，该毒株与NADC30-like毒株处于同一进化分支，属于lineage 1。基于GP5和Nsp2蛋白的氨基酸序列分析显示，分离株GP5蛋白糖基化位点位于34位、44位和51位；在37-45 aa的线性表位区较为保守，在27-30 aa和37-45 aa的线性表位区存在特异的氨基酸位点变异；Nsp2蛋白存在NADC30-lke毒株特征性的131个（323-433位、483位、504-522位）不连续氨基酸的缺失。基因重组分析显示，该毒株以类NADC30为主要亲本、以类JXA1为次要亲本，在Nsp2的氨基端（1 340-2 082 nt）发生了基因重组。本研究成功绘制了1株NADC30-like毒株的基因组遗传特征，确定了其在Nsp2区域发生了基因重组，提示PRRSV通过基因重组在不断发生遗传演化，开展持续的PRRSV流行及遗传变异监测对于该病的防控具有重要意义。

来源：2020年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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