畜牧兽医学报

作者：周泷, 康润敏, 张毅, 谢波, 于吉锋, 李春, 张斌, 汤承, 王红宁

单位：1. 西南民族大学生命科学与技术学院, 成都 610041;2. 四川省畜牧科学研究院, 成都 610066;3. 四川省动物疫病预防控制中心, 成都 610041;4. 成都正大农牧食品有限公司, 成都 610081;5. 四川大学生命科学学院, 成都 610064

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒,病毒分离鉴定,全基因组,缺失,重组

基金：四川省科技计划项目（2016NZ0006）；四川省科技计划项目（2016NYZ0042）；四川省财政运行专项（SASA2014CZYX009）；国家现代农业体系四川创新团队建设（Sccxtd-004）；四川省应用基础项目（2019YJ0561）；四川省科技计划重点研发项目（2018NZ0130）

本研究旨在了解近年来我国四川、贵州地区猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的分子流行病学及遗传变异情况，对该地区2016—2018年间采集的8份PRRSV阳性样品进行病毒分离鉴定和全基因组测序，进一步使用RDP4和Simplot生物软件对全基因序列进行重组分析。结果显示，8个PRRSV毒株全基组全长为15 010~15 321 nt，毒株间相似性为80.9%~91.7%。NSP2氨基酸分析结果显示，4个毒株表现出与HP-PRRSV毒株一致的30 aa缺失，另外4株表现出与NADC30毒株一致的131 aa缺失。其中，GZgy17表现为“1+19+29 aa”新型缺失模式。ORF5氨基酸分析显示，3个毒株在33位点出现新型的1 aa缺失。遗传重组分析显示，8个毒株表现出PRRSV-2毒株6种不同谱系（Lineage）间的重组方式，分别如下：1） SCnj16：L8+L1；2） SCxyz17：L1+L5；3） SCya18：L1+L3；4） GZgy17：L8+L3；5） SCcd17和SCN17：L1+L8+L5；6） SCcd16和SCya17：L1+L8+L3。本研究结果表明，我国四川、贵州地区不仅有多种谱系PRRSV毒株并存，其基因组还出现了复杂的遗传重组现象，具有上述复杂基因组的PRRSV毒株在我国的流行状况值得高度关注。

来源：2020年第6期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2020年第6期