畜牧兽医学报

作者：吕世杰, 陈付英, 金磊, 张子敬, 朱肖亭, 施巧婷, 辛晓玲, 楚秋霞, 柏中林, 王二耀, 徐照学

单位：1. 河南省农业科学院畜牧兽医研究所, 郑州 450002;2. 河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室, 郑州 450002;3. 泌阳县动物疫病预防控制中心, 驻马店 463700

关键词：南阳牛,生长性状,候选基因,选择性清除,遗传分化系数

基金：国家重点研发计划（2018YFD0501700）；河南省肉牛产业技术体系项目（S2013-08）；国家肉牛牦牛产业技术体系项目（CARS-37）；科研发展专项资金项目（2019CY08）；河南省农业科学院科技创新创意项目（2020CX09）

旨在探究安格斯牛生长相关的受选择基因，为肉牛生长相关主效基因的鉴定提供参考。本试验共采集72头南阳牛母牛和14头黑安格斯牛母牛血样并提取基因组DNA。利用SLAF-seq（specific-locus amplified fragment sequencing）技术获得全基因组SNP标记并对试验个体基因型进行分型。通过计算各SNP位点的遗传分化系数（Fst值）和核苷酸多态性（π ratio）筛选两品种间的差异基因组区域，并与动物QTL数据库中牛生长性状QTLs进行比对，重合区域作为候选区域。随后对候选区域内基因进行功能注释以筛选候选基因，并根据"Expression Atlas"数据库对候选基因的组织表达情况进行分析。经筛选后，本试验共得到69 762个SNPs，以Fst值和π ratio值的99%分位数为阈值筛选得到33个两品种间高度差异的基因组区域，其中16个基因组区域与生长性状相关QTLs重合。这些区域共包含27个基因，其中4个基因（FXR1、ADAR、IGF1和MNF1）与骨生长、肌肉发育和生长调控有关。FXR1和MNF1均在骨骼肌组织中高表达，ADAR和IGF1分别在脑组织和肝脏中表达最高。结果提示，IGF1基因可作为影响肉牛生长的关键候选基因，FXR1、ADAR、MNF1基因可优先进行进一步验证研究。

来源：2020年第4期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2020年第4期