国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:潘永, 刘丽娟, 杨阳, 李晨, 马光强, 杨琦
单位:1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学动物疫病研究所, 贵阳 550025;3. 贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室, 贵阳 550025;4. 贵州省畜禽资源遗传管理站, 贵阳 550025;5. 都匀市农业农村局, 都匀 558000;6. 黔南民族职业技术学院, 都匀 558000
关键词:沙门菌,小RNAGcvB,转录组测序,靶基因
基金:国家自然科学基金(31760740;31602065);贵州省科技厅联合资金项目贵州大学2017年度学术新苗培养及创新探索专项(黔科合LH字[2017]7263;黔科合平台人才[2017]5788);贵州省科技厅基金(黔科合基础[2016]1047);贵州省研究生教育创新计划项目(GZZ2017002)
gcvB基因敲除株的转录组测序结果注释到KEGG数据库以及GO富集分析,并利用荧光定量PCR对预测的靶基因进行验证。TargetRNA2的预测结果显示,杂交能量最高的narY、yeaK、trpB和STM2732基因均能够和小RNA GcvB产生至少7个连续的碱基互补,narY、yeaK和trpB基因分别与鼠伤寒沙门菌无氧呼吸、脯氨酸与tRNA的识别以及色氨酸的合成相关。荧光定量PCR检测结果显示,narY、yeaK、trpB和STM2732基因在gcvB基因敲除条件下转录水平分别上调3.4、9.8、12.1和18.37倍。以上结果表明,narY、yeaK、trpB和STM2732基因受小RNA GcvB的负调控且可能为直接负调控。本研究为进一步探明小RNA GcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制以及沙门菌致病机制奠定了基础。
来源:2020年第4期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部