畜牧兽医学报

作者：李正杰, 周先坤, 王浥尘, 陈玉慧, 褚天琪, 秦昱疌, 唐楷, 李学伟, 马继登

单位：1. 四川农业大学动物科技学院, 畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室, 成都 611130;2. 四川鹿鸣丘高原生态农业科技有限公司, 若尔盖 624500

关键词：若尔盖地区,藏猪,mtDNA,D-Loop,单倍型,遗传多样性

基金：国家重点研发计划（2018YFD0501204）；四川省科技厅重点研发项目（2019YFN0035）；国家生猪产业技术体系（CARS-35-01A）；国家自然科学基金（31601918）

旨在通过获得和对比若尔盖地区藏猪mtDNA D-Loop高变区的部分序列，为该地区藏猪遗传资源的保护与利用提供参考。本试验收集了若尔盖地区9个乡镇共80头藏猪耳组织，以甘南州藏猪mtDNA D-Loop基因序列为模板设计引物，采用PCR扩增测序技术获得了80条核苷酸序列，并采用生物信息学的数据处理方法进行分析。结果表明，若尔盖地区藏猪mtDNA D-Loop高变区（435 bp）的A+T含量（56.46%）明显高于G+C含量（43.54%），存在碱基偏倚性现象；在80条长度为435 bp的序列中，共检测到14个变异位点，鉴定了17个单倍型，单倍型多样度（Hd）、核苷酸多样度（Pi）和平均核苷酸差异数（k）分别为0.881、0.004 66和2.028，其中Hd、Pi和k在降扎乡藏猪群体中最高，Pi和k在占哇乡藏猪中最低；共享单倍型8个，特有单倍型9个，且若尔盖地区不同藏猪群体间特有单倍型数差异较大，其中，降扎乡藏猪的特有单倍型数量最多，占单倍型总数的17.65%（3/17）；Hap_1和Hap_15单倍型是4个乡镇（降扎乡、益哇乡、热尔乡和冻列乡）群体的共享单倍型，表明这4个乡镇藏猪群体存在两个共同的母系祖先单倍型。若尔盖地区藏猪的平均遗传距离为0.004 66，其中降扎乡和冻列乡藏猪间的遗传距离最大为0.006 90，包座乡和益哇乡藏猪间的遗传距离最小为0.002 16；构建的NJ分子系统进化树将若尔盖地区藏猪分为2支，而加入中国地方家猪、野猪和引种猪后，若尔盖地区藏猪在进化树中比较分散，说明该地区藏猪母源血统遗传复杂，彼此之间基因交流多。本研究进一步证实了若尔盖地区藏猪比西藏林芝、山南、日喀则、甘孜州、阿坝州藏猪的遗传多样性程度高，受到人工选择强度低，应强化对若尔盖地区藏猪遗传资源的保护与利用。

来源：2019年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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