畜牧兽医学报

作者：袁茂, 江明锋, 徐亚欧, 林亚秋, 蒋小松, 杨朝武, 余春林, 李志雄

单位：1. 西南民族大学生命科学与技术学院 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室, 成都 610041;2. 西南民族大学生命科学与技术学院 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室, 成都 610041;3. 四川省畜牧科学研究院, 成都 610066

关键词：藏鸡,肌肉发育,转录组,miRNA

基金：四川省“十三五”畜禽育种攻关项目（2016NYZ0043）；四川省应用基础项目（2016JY0068）；中央高校基本科研业务费专项资金项目（2018NQN10）

旨在从转录组和miRNA角度探讨藏鸡肌肉发育的调控机制，了解藏鸡肌肉发育的特殊性。本研究对120和150日龄藏鸡的肌肉组织进行转录组和small RNA测序，筛选出两个日龄阶段差异表达的基因和miRNA，并利用qRT-PCR技术对测序结果进行验证。结果，共筛选出1 691个差异表达基因，其中上调基因330个，下调基因1 361个。差异表达miRNA共有22个，其中9个上调，13个下调。随机选择的5个基因和miRNAs的qPCR验证结果表明表达趋势与测序结果一致。GO富集分析显示，在富集前10的条目中，与免疫相关的条目占较大比例。KEGG分析结果显示，在19个显著富集通路中，与免疫相关的通路占较大比例，且83个miRNA的靶基因出现在显著富集通路上。转录组和small RNA测序数据联合分析表明，343个miRNA-mRNA对为负相关调控模式。本研究从多组学层面为进一步理解藏鸡的肌肉发育提供了理论基础。

来源：2019年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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