畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2019年第12期:基于转录组测序筛选鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失菌的差异表达基因

发布日期:

作者:杨阳, 杨琦, 董然然, 潘永, 李晨, 刘丽娟, 文明, 周碧君, 王开功

单位:1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学动物疫病研究所, 贵阳 550025;3. 贵州省动物疫病研究室, 贵阳 550025;4. 贵州省畜禽资源遗传管理站, 贵阳 550025;5. 贵州都匀市动物疫病预防控制中心, 都匀 558000

关键词:沙门菌,沙门菌hfq基因缺失株,sRNA伴侣蛋白Hfq

基金:国家自然科学基金(31602065);贵州省科学技术基金(科合LH字[2017]7263;黔科合平台人才[2017]5788;黔科合基础黔科合基础[2016]1047);贵州大学博士基金项目(贵大人基合字(2015)61号)

旨在鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序中分析适应环境变化及细菌分泌通路,筛选相关基因。通过使用实时荧光定量PCR对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序结果进行验证,从而对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株的细菌趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路进行深入分析,筛选相关的重要调控基因。结果显示:在细菌趋化性通路中筛选出yiaD、STM3138、STM3216和malE等4个共表达基因;在细菌分泌通路中筛选出spaP、invA、prgH、invE、spaS、invG和ssaV等7个共表达基因;在细菌双组分通路中筛选出ybfM、htrA、pagO、STM3138、STM3031、ttrB、hilD、pstS、STM1530、hilA、pgtC、hydH、pocR、STM3216、ttrR和fljB等16个共表达基因。在鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株的趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路中筛选出差异表达基因,hfq能够对这些基因进行调控,从而影响如运动性、毒力等相关作用,为沙门菌中的sRNA与hfq后续研究及沙门菌的防治奠定一定基础。

来源:2019年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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