国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:李龙龙, 朱燕玲, 曾斌, 何家建, 孙加节, 陈婷, 罗君谊, 张永亮, 习欠云
单位:华南农业大学动物科学学院, 国家生猪种业工程技术研究中心, 广东省动物营养调控重点实验室, 广州 510642
基金:“十三五”国家重点研发计划(2016YFD0500503;2016YFD0501205);国家自然科学基金(31872435;31802156;31802032);广东省自然科学基金(2016A030313413)
旨在研究miR-125b-2对动物精子发生和成熟的调节作用,挖掘与miR-125b-2有密切靶向关系的功能基因及信号通路。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,构建了miR-125b-2基因敲除小鼠模型。将3只野生型(WT)小鼠和3只miR-125b-2敲除型(KO)小鼠睾丸的总RNA样分别制成样品池,采用Illumina HiSeqTM4000平台进行转录组测序(RNA-seq),将组装得到的Unigene序列注释到Nr和KEGG数据库中注释,并进行睾丸差异表达基因(DEGs)聚类分析。结果显示,在WT和KO组睾丸组织中共筛选出324个DEGs,其中被GO注释的180个DEGs显著富集到80个包括精子染色质缩合在内的生物学过程,22个含有线粒体内膜预序列转位酶复合物在内的细胞组成以及41个包括核糖体结构组成在内的分子功能。同时KEGG分析显示,所有被注释的DEGs显著富集到74条信号通路,其中排前3位极显著的信号通路依次为:RNA转运、信使RNA监视通路和合硒化合物新陈代谢。综上表明,敲除miR-125b-2主要影响睾丸中与精子染色质结构和线粒体功能相关基因的表达,其中与精子发生相关的3个基因Papolb、Tssk1和Slc22a14表达均显著上调。结果为进一步研究miR-125b-2对精子生成的功能调节提供基础。
来源:2019年第10期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部