畜牧兽医学报

作者：韩硕, 王宇轩, 刘娟, 邹紫雯, 李鑫丽, 罗林, 沈冰蕾

单位：黑龙江八一农垦大学, 动物科技学院, 大庆 163319

基金：黑龙江八一农垦大学研究生科研创新资助项目（YJSCX2018-Y33）；中国博士后科学基金项目（2018M631970）；黑龙江省博士后启动基金项目（LBH-Z16166）；黑龙江省教育厅科学技术研究项目（12521365）；黑龙江八一农垦大学校青年创新人才项目（CXRC-2016-06）；黑龙江省牛病防制重点实验室开放课题（PCBD201708）；黑龙江八一农垦大学博士启动基金项目（XDB-2017-06）

旨在预测奶牛microRNA-223（bta-miR-223）的候选靶基因，并对其进行蛋白质互作分析、信号通路富集分析，构建其可能参与的调控网络，为bta-miR-223参与乳腺炎抗性调控机制研究提供理论依据。利用Targetscan和miRWalk在线分析工具预测其候选靶基因，利用STRING和DAVID在线分析工具分别对候选靶基因进行蛋白质互作分析以及KEGG通路分析，最后使用Cytoscape可视化软件绘制bta-miR-223候选靶基因可能重点参与的调控网络。结果表明，bta-miR-223候选靶基因FBXO30与SMURF2，FBXW7与UBA2等存在蛋白互作关系。KEGG通路富集分析结果显示，这些候选靶基因参与上皮细胞的细菌入侵、胞吞作用以及PI3K-Akt、TGF-β、AMPK等信号通路。结果提示，bta-miR-223的候选靶基因FBXO30、SMURF2、FBXW7、UBA2等可能通过参与抗原加工、先天免疫系统和中性粒细胞脱颗粒反应，以及上皮细胞的细菌入侵、胞吞作用、PI3K-Akt等信号通路发挥重要作用。

来源：2019年第10期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2019年第10期