国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:李丽敏, 邹云婧, 郝雪飘, 赵兴华, 李睿文, 孙继国, 袁万哲
单位:1. 河北农业大学动物医学院, 保定 071001;2. 河北省兽医生物技术工程技术研究中心, 保定 071001
基金:河北省自然基金项目(C2016204191);河北省高校百名优秀创新人才支持计划(SLRC2017039);河北省现代农业产业技术体系羊产业创新团队专项资金(HBCT2018140204)
脑心肌炎病毒(EMCV)可感染人和多种动物。为了探索EMCV对N2a细胞转录组的影响,揭示基因表达与致病性之间的关联,本研究用EMCV BD2毒株感染N2a细胞,收集感染后7 h的细胞样本,提取总RNA,使用NimbleGen杂交体系将标记好的ds-cDNA与小鼠基因表达谱芯片杂交,对芯片进行扫描,获得差异表达基因数据;应用生物信息学方法对筛查出的差异表达基因数据进行分析,筛选差异表达的免疫相关基因及信号通路;利用real-time FQ-PCR方法,对微阵列数据结果进行验证。结果表明,EMCV感染N2a细胞后共有21 143个差异表达基因;通路分析表明,差异表达的主要信号通路包括PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、细胞因子间相互作用、趋化因子信号通路、TCR/RLR信号通路和细胞凋亡通路等;Real-time FQ-PCR检测的10个差异表达基因的变化情况与通过微阵列分析预测的变化一致。
来源:2019年第8期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部