畜牧兽医学报

作者：巩建飞, 岳静伟, 赵玲玲, 刘运鹏, 王立贤, 刘欣, 孙金海

单位：1. 青岛农业大学动物科技学院, 青岛 266109;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

基金：转基因生物新品种培育重大专项（2016ZX08006001-006）；中国农业科学院科技创新工程（ASTIP-IAS02）

旨在探究HMGA1基因在猪不同组织、不同日龄下不同品种中的表达谱，并对该基因编码区及3'UTR区的多态性与猪背膘厚进行关联分析。本研究利用实时荧光定量PCR检测大白猪HMGA1基因在7种组织的表达情况，及其在60、150和210日龄大白猪和民猪背部脂肪中的差异表达。对576头大白猪×民猪F2代资源群体的基因组DNA重测序进行HMGA1序列分析，筛选其编码区及3'UTR区SNPs，并以屠宰体重为协变量与背膘厚（第6~7肋）进行关联分析。结果表明，HMGA1 mRNA在大白猪不同组织中均有表达，且在组织间存在显著差异（P<0.05），其中在肺中的表达量最高，而在心和肌肉中微量表达。在60和150日龄时，HMGA1基因在民猪背部脂肪中的表达量显著高于大白猪（P<0.05）；210日龄时在两个猪种中的表达差异不显著（P>0.05）。通过对F2群体HMGA1序列分析，在编码区检测出13个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）位点，其中包含2个错义突变位点：g.3261G>A和g.5818G>A，且g.3261G>A位点与背膘厚显著关联（P<0.05）。在3'UTR区检测到3个SNPs，且位于小RNA（microRNA，miRNA）结合靶点，其中g.7217G>C和g.7280T>C与背膘厚显著关联（P<0.05）。研究结果表明，HMGA1作用于猪背部脂肪组织，且该基因g.3261G>A、g.7217G>C和g.7280T>C位点可作为猪背膘厚选育的潜在分子标记，为猪的分子育种奠定基础。

来源：2019年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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