畜牧兽医学报

作者：施会彬, 王玉琴, 张小辉, 吴至博, 杨芳

单位：1. 河南科技大学, 洛阳 471023;2. 河南省肉羊繁育工程技术研究中心, 洛阳 471023

基金：国家自然科学基金面上课题（31472095）

旨在通过对不同光照时长条件下河南槐山羊下丘脑组织进行转录组测序和生物信息学分析，筛选出与山羊繁殖相关的信号通路及候选基因。本研究利用Illumina二代高通量测序平台（NGST），采用PE150测序策略，对经自然光照（8 h光照：16 h黑暗）与人工光照（16 h光照：8 h黑暗）条件处理后的8只空怀母羊（每组各4只，平均年龄1周岁）下丘脑组织进行转录组测序，将组装得到的Unigene总数比对到参考基因组序列，进行差异表达基因分析、GO和KEGG富集分析以及候选基因筛选，并采用Real-time PCR方法对候选基因的相对表达量变化进行分析。结果显示，RNA-Seq共得到了约4.4亿条reads，平均每个样本的reads数约为5 249万条；自然光照与人工光照2组DESeq分析得到448个差异表达基因，并富集在KEGG数据库中的241个信号通路，其中包括5个与繁殖相关的信号通路；3个速激肽家族候选基因（TACR1、TACR2和TACR3）显著富集在Calcium signaling pathway（钙离子信号通路，chx04020）通路；Real-time PCR分析结果显示，转录组测序结果可靠。综上表明，Calcium signaling pathway（钙离子信号通路，chx04020）与TACR1、TACR2和TACR3基因，可能在山羊繁殖过程中发挥着重要作用。

来源：2019年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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