畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2019年第7期:湖羊卵巢不同发育阶段的miRNA鉴定与分析

发布日期:

作者:解领丽, 李嫒, 黄万龙, 张秀秀, 苗向阳

单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 动物营养学国家重点实验室, 北京 100193

基金:转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08008-004;2008ZX08008-003);农业科技创新工程(ASTIP-IAS05);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(Y2016JC22;Y2018PT68)

旨在分析不同发育阶段绵羊卵巢组织中miRNA的表达水平,了解miRNA表达及其调控机理。本研究采用转录组测序技术鉴定1和8月龄湖羊卵巢组织中的miRNA,运用生物信息学方法对差异表达的miRNA进行靶基因预测,并对靶基因进行GO和KEGG功能注释,筛选参与卵巢发育的miRNAs。结果显示,6个样品中检测到的已知miRNA个数分别为2 186、2 091、2 217、2 136、2 176、2 088,新miRNA的个数分别为613、567、668、640、662、450。筛选到701个差异表达novel miRNAs,38个差异表达已知miRNAs。对差异表达miRNAs的靶基因进行GO和KEGG分析,发现主要富集在血管内皮生长因子通路和卵巢类固醇生成等过程。对3个差异miRNAs进行qRT-PCR验证,与测序结果一致。oar-let-7b、oar-miR-29a、oar-miR-134-3p、oar-miR-541-3p等的靶基因富集在TGF-beta通路、卵巢卵泡生长等与卵巢发育相关的生物过程。oar-miR-148a、oar-miR-136的靶基因调控颗粒细胞增殖和类固醇生成,可能参与调控绵羊卵巢发育。

来源:2019年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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