畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2019年第5期:牦牛不同年龄肌肉组织microRNA表达谱及生物信息学分析

发布日期:

作者:纪会, 王会, 柴志欣, 王吉坤, 王嘉博, 罗晓林, 姬秋梅, 信金伟, 钟金城

单位:1. 西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室, 成都 610041;2. 四川省草原科学研究院, 成都 611731;3. 西藏自治区农牧科学院 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室, 拉萨 850009

基金:西南民族大学研究生创新型科研项目(CX2018SZ113);国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)

旨在挖掘牦牛不同年龄肌肉组织中miRNA表达谱,分析其生物学特征,以探索其在牦牛肌肉发育过程中的调节模式。本研究构建0.5、2.5、4.5和7.5岁肌肉组织的4个小RNA文库,利用Solexa技术进行测序,用生物信息学方法和RT-qPCR技术对测序结果进行分析和验证。结果,获得各miRNAs分别在4个年龄段肌肉组织中的表达量,在7.5岁肌肉组织中发现58个共同与0.5、2.5、4.5岁差异表达的miRNAs,其中53个miRNAs在7.5岁肌肉组织中显著下调,5个显著上调。运用R语言进行GO富集和KEGG信号通路分析,58个miRNAs可能通过PI3K-Akt、MAPK、Ras和肌动蛋白细胞骨架调节通路(regulation of actin cytoskeleton)参与调节牦牛肌肉细胞的增殖与分化,且PI3K-Akt、MAPK、Ras 3个信号通路共同靶向53个靶基因,说明3个信号通路相互关联。随机选择8个miRNAs进行RT-qPCR验证,结果表明其中7个miRNAs的表达趋势与测序结果一致。结果表明,牦牛肌肉发育可能受到多种miRNA的调控并涉及多个信号通路,有助于构建肌肉组织中miRNA的调控网络,为进一步研究miRNA调控哺乳动物肌肉发育奠定了理论基础。

来源:2019年第5期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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