国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:钟纯燕, 李基棕, 毛立, 李文良, 郝飞, 孙敏, 刘茂军, 主性, 嵇辛勤, 肖芳, 杨蕾蕾, 张纹纹
单位:1. 江苏省农业科学院兽医研究所, 农业部兽用生物制品工程技术重点实验室, 南京 210014;2. 临沂大学药学院, 临沂 276000;3. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025
基金:国家自然科学基金(31702272);江苏省自然科学基金(BK2017059);山东省自然科学基金(ZR2016CP08);"十三五"国家重点研发计划项目(2016YFD0500908)
本研究旨在探究山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞后的转录组基因变化情况,丰富CPIV3转录组信息。取1 MOI CPIV3 JSHA2014-1病毒液感染MDBK细胞,设非感染正常细胞为对照,于24 h后收获细胞,提取总RNA,利用Illumina HiSeqTM 2500对感染组与对照组进行高通量测序,并用测序评估、基因注释等生物信息学方法进行分析。结果显示,差异表达基因共261个,其中表达上调140个,表达下调121个,经RT-qPCR方法验证8个差异表达的干扰素信号通路相关基因,结果与高通量测序一致。进一步GO分类结果显示,差异表达基因主要涉及细胞生物学进程、构成细胞的组分以及实现的分子功能三个方面,KEGG分析显示这些基因参与代谢、生物系统、细胞进程、基因信息进程和环境信息进程。本研究为深入探究CPIV3的致病机制奠定了基础。
来源:2019年第2期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部