畜牧兽医学报

作者：彭潇, 尹立林, 梅全顺, 王海燕, 刘小磊, 朱猛进, 李新云, 付亮亮, 赵书红

单位：1. 华中农业大学, 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 武汉 430070;2. 生猪健康养殖协同创新中心, 武汉 430070

基金：国家生猪产业技术体系项目（CARS-35）；国家自然科学基金地区间国际重大合作项目（CGIAR31361140365）；国家自然科学基金（31672391）；华中农业大学大北农青年学者提升专项资助项目（2017DBN019）

旨在系统比较GBLUP、SSGBLUP、BayesA、BayesB、BayesC、BayesLASSO、BSLMM和BayesR等8种方法对猪重要经济性状基因组选择的准确性。本研究以本实验室收集的2 585头大白猪达100 kg日龄、达100 kg背膘厚和母猪乳头数3个性状为分析对象，结合猪50K基因芯片分型数据，以加性模型为基础，利用5倍交叉验证比较8种方法的基因组选择准确性。研究发现，基因组选择的准确性与不同性状估计遗传力呈正相关。交叉验证结果表明，预测准确性最高的性状为达100 kg日龄，但不同方法在不同性状中表现并不完全相同，在达100 kg日龄和达100 kg背膘厚中SSGBLUP基因组预测准确性均为最高，而在母猪乳头数中BayesA的基因组预测准确性最高。综上表明，对小样本开展基因组预测时，中、高等遗传力性状可以选择SSGBLUP方法，低等遗传力性状可以选择BayesA方法。如何优化和选择一种广泛适用于所有性状的方法，可能是未来研究的方向。

来源：2019年第2期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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